Rokotusohjelmien ylläpitäminen on tärkeää, jotta Suomessa pysyy yllä voimakas laumasuoja. Kun suurin osa lemmikeistä on rokotettu, vaarallisilta epidemioilta vältytään. Myös matkustaessa yksilön suojaaminen on tärkeää, koska ulkomailla ei ole samanlaista laumasuojaa mitä meillä Suomessa. Useimmiten koirat rokotetaan raivotautia, parvoa, tarttuvaa maksatulehdusta, kennelyskää ja penikkatautia vastaan. Kissoilla tärkeimmät rokotukset annetaan kissaflunssa ja kissaruttoa vastaan. Pennut rokotetaan normaalisti (8) 12 ja 16 viikon iässä, ja rokotesuoja vahvistetaan vuoden iässä, minkä jälkeen se on voimassa kolme vuotta. Kennelyskää vastaan vastustuskyky on lyhytaikainen, joten rokote tulee uusia vuosittain.